Di norma il museo è visitabile (solo con visita guidata) il giovedì pomeriggio dalle 14.30 una o due volte al mese, e un sabato al mese dalle 12 alle 13. I gruppi dovrebbero essere inferiori a 15 persone. Sono consigliabili gruppi non superiori alle 8 persone. Le visite vengono sempre riconfermate il giorno precedente.

Da novembre il Wundermusaeum riprende le visite guidate. Tra la fine di novembre 2023 e il febbraio 2024, in concomitanza con la mostra a Palazzo Barberini La città del sole. Arte barocca e pensiero scientifico nella Roma di Urbano VIII, i visitatori potranno prenotare su appuntamento visite guidate tematiche sui protagonisti del pensiero scientifico al Collegio Romano nella Roma di Urbano VIII.

 https://youtu.be/U2ejeVQKTAY?si=gkmtAuW98HuM5F8m : a questo link il filmato della visita virtuale